Департамент по контролю (надзору) в сфере образования (директор - Багашев Сайдахмет Алиевич; заместитель - Такаев Мовсар Адланович)
Департамент общего образования (директор - Хасуева Зулай Шариповна)
Департамент дополнительного образования и программной деятельности (директор - Султанова Хулимат Зелимхановна).
- Отдел проектной и программной деятельности (начальник отдела - Куруев Рамзан Хамидович).
- Отдел дополнительного образования и защиты прав детей (начальник отдела - Гучигов Асланбек Аликович).
ГКУ «Управление по обеспечению деятельности Министерства образования и науки Чеченской Республики» (начальник управления - Байдарова Манаша Вахитовна).
- Информационный отдел (начальник отдела - Юнусов Алихан Алхазурович).
- Организационный отдел.
- Отдел бухгалтерского учета и отчетности (начальник отдела - Гузуева Индира Исаевна).
- Отдел учета расчетов с дебиторами и кредиторами (начальник отдела - Вагапов Адам Зайндаевич).
- Отдел учета материальных ценностей и заработной платы (начальник отдела - Мумаева Зарета Султановна).
- Отдел экономики и статистики (начальник отдела - Байдарова Эльза Вахитовна).
- Отдел планирования (начальник отдела - Тепсаев Эдуард Ахьядович).
- Отдел делопроизводства и электронного документооборота (начальник отдела - Темерсултанова Фатима Мовладиевна).
- Отдел капитального строительства, охраны труда и общей безопасности (начальник отдела - Миктаев Ислам Абасович).
- Отдел административно-хозяйственной деятельности (начальник отдела - Абдурахманов ХамзатУахович).
ГБУ «Хозяйственно-техническое управление» (начальник управления - Сулейманов Магомед Салаудинович)
- Отдел материального снабжения и технического обеспечения (начальник отдела - Муртазов Хаваж Сайдалиевич).
- Отдел административно-хозяйственной деятельности